Comparación de diferentes métodos de extracción de ADN genómico en babosas plagas (mollusca: gasterópoda)

Contenido principal del artículo

Luis Angulo Graterol
Guillermo Antonio Perichi Cabrera
Luis Dinitri Castro Chacín
Rosana Figueroa Ruiz

Resumen

La presente investigación fue planteada con el objetivo de comparar tres métodos de extracción
de ADN en muestras de tejido epitelial de babosa (Mollusca: Gasterópoda). Se utilizaron los
protocolos: (1) Extracción con SDS (SDS); (2) Extracción con CTAB y 2β-mercaptoetanol (CTABβ); y (3) Extracción con SDS y proteinasa K (SDSpK); para determinar el método más apropiado
de obtención de ADN, de alto peso molecular y pureza, para ser utilizado en análisis genético.
Se utilizó la especie de babosa (Arion subfuscus) y seis repeticiones, para un total de 18
observaciones. La concentración y pureza del ADN se estimó espectrofotométricamente
midiendo su absorbancia a 260 nm y la relación Abs260/Abs280 nm, respectivamente. Esos datos
fueron utilizados para realizar el análisis estadístico, de acuerdo a un diseño completamente al
azar con seis repeticiones. En el análisis de la varianza se detectaron diferencias significativas
(p<0,01) para la cantidad, concentración y pureza entre los protocolos. En la prueba de
comparación entre medias de Tukey, el protocolo (SDSpK) permitió obtener ADN con mayor
peso molecular (2 514,90±291,56) y pureza (1,97±0,02). La calidad del ADN de cada protocolo
fue verificada mediante PCR-RAPD. Se observó poca reproducibilidad para el cebador OPA-02,
del ADN obtenido mediante el procedimiento de extracción SDS; mientras que en los otros
métodos se logró obtener ADN sin degradación y puro, lo cual permitió observar perfiles de
amplificación de alta resolución y bandas reproducibles. Se recomienda utilizar el protocolo
(SDSpK) para la obtención de ADN genómico de alto peso molecular, calidad y pureza en
babosas.

Descargas

La descarga de datos todavía no está disponible.

Detalles del artículo

Cómo citar
Angulo Graterol, L., Perichi Cabrera, G. A. ., Castro Chacín, L. D., & Figueroa Ruiz , R. (2020). Comparación de diferentes métodos de extracción de ADN genómico en babosas plagas (mollusca: gasterópoda). REVISTA CIENTÍFICA ECOCIENCIA, 7(4), 35–49. https://doi.org/10.21855/ecociencia.74.380
Sección
Artículos
Biografía del autor/a

Luis Angulo Graterol, Docente e Investigador categoría Asistente del Departamento e Instituto de Genética y Jefe del Laboratorio de Genética Molecular del Centro de Investigaciones en Biotecnología Agrícola de la Facultad de Agronomía de la Universidad Central de Venezuela. Venezuela.

Doctor en Ciencias Agrícolas, Universidad Central de Venezuela (Venezuela).

Guillermo Antonio Perichi Cabrera, Docente e Investigador categoría Agregado del Departamento e Instituto de Zoología Agrícola, Jefe de Cátedra de Zoología Agrícola y Coordinador del Laboratorio de Nematología Agrícola de la Facultad de Agronomía de la Universidad Central de Venezuela. Venezuela.

Magister Scientiarum en Agronomía, Universidad Central de Venezuela (Venezuela).

Luis Dinitri Castro Chacín, Profesional de Investigación 6-V del Instituto Nacional de Investigaciones Agrícolas, Centro Nacional de Investigaciones Agrícolas, Maracay, Venezuela.

Licenciado en Agroecología de la Universidad Bolivariana de Venezuela (Venezuela).

Rosana Figueroa Ruiz , Docente e Investigadora categoría Asociada del Departamento e Instituto de Ingeniería Agrícola de la Facultad de Agronomía, Universidad Central de Venezuela, Venezuela.

Doctora en Mejoramiento Genético de Plantas de la Universidad de Minnesota (EEUU).

Citas

Chakraborty, S.; S. Anwesha and N. Aravind. (2020). Comparison of DNA extraction methods

for non-marine molluscs: Is modified CTAB DNA extraction method more efficient than

DNA extraction kits? Biotech 10:69. doi.org/10.1007/s13205-020-2051-7

Córdoba, M. (2009). Predicción de plagas de gasterópodos terrestres en Galicia. Tesis doctoral,

Universidad Santiago de Compostela Galicia, España, 462.

Fraga, J., Rodríguez, J., Fuentes, O., Castex, M. y Fernádez, A. (2004). Comparación entre cinco

métodos para la extracción de ADN de triatomíneos: Su utilización en la técnica de ADN

polimórfico amplificado al azar. Revista Cubana de Medicina Tropical. (56), 208-213.

Gutiérrez, D.; A. Beltramino; R. Vogler; M. Cuezzo; V. Núñez; S. Gomes; M. Virgillito; and S.

Miguel. (2013). First records of four exotic slugs in Argentina. American Malacological

Bulletin 31(2): 245-256.

Jaksch, K.; A. Eschner; T. Rintelen and E. Haring. (2016). DNA analysis of molluscs from a

museum 20 wet collection: A comparison of different extraction methods. BMC Research

Notes. (9):1-12. doi: 10.1186/s13104-016-2147-7

Levitan, D. and R. Grosberg. (1993). The analysis of paternity and maternity in the marine

hydrozoan Hydractinia symbiolongicarpus using randomly amplified polymorphic DNA

(RAPD) markers. Molecular Ecology. (2), 315-326.

Mc Donnell, R.; P. Rugman; T. Backeljau; K. Breugelmans; K. Jordaens; R. Stouthamer; T.

Paine and M. Gormally. (2011). Molecular identification of the exotic slug Arion

subfuscus sensu stricto (Gastropoda: Pulmonata) in California, with comments on the

source location of introduced populations. Biology Invasions. (13), 61-66.

Mikhailova, N. and K. Johannesson. (1998). A comparison of different protocols for RAPD

analysis of Littorina. Hydrobiologia. (378), 33-42.

Morinha, F.: P. Travassos; D. Carvalho; P. Magalháes; J. Cabral and E. Bastos. (2014). DNA

sampling from body swabs of terrestrial slugs (Gastropodo: Pulmonata): A simple and

non-invasive method for molecular genetics approaches. Journal of Molluscan Studies.

(80), 99-101. Doi:10.1093/mollus/eyt045

Perichi, G. (2014). Identificación de la malacofauna de interés agrícola del municipio Tovar,

estado Aragua, Venezuela. Facultad de Agronomía, Universidad Central de Venezuela.

Maracay, Venezuela. Trabajo de Ascenso. 86 pp.

Ross, J., Ivanova, E., Spiridonov, S., Waeyenberge, L., Moens, M., Nicol, G. & Wilson, M. (2010).

Molecular phylogeny of slug-parasitic nematodes inferred from 18 rRNA gene seuences.

Molecular Phylogenetics and Evolution. (55), 738-743.

Sambrook, J., Fritsch, E. & Maniatis, T. (1989). Molecular cloning: a laboratory guide. 2.a edition,

Salem, MA: Cold Spring Harbor Laboratory Press; 1989.

SAS Institute Inc. SAS/STAT® User´s Guide, Release 6.03 Editions. Carry, NC USA. SAS

Institute Inc., 1988. 1028p.

Soroka, M. and T. Kaluski (2011). Genetic studies on the invasive slug Arion lusitanicus Mabille,

(GASTROPODA: PULMONATA) in Poland. Folia Malacologica. Vol. 19(4), 259-

doi:10.2478/v10125-011-0026-3

Soroka, M. and G. Skujiené. (2011). Species identification of slugs of genus Arion Férrusac,

(Mollusca, Pulmonata) on the basis of genetics. Ekologija. (57), 70-80.

Williams, J.; A. Kubelik; K. Livak; J. Rafalski and S. Tingey. (1990). DNA polymorphisms

amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Research.

(18), 6531-6535.

Wraith, J. (2012). Mucopolysaccharidoses and oligosaccharidoses. In: Saudubray, M., Van Den

Berghe, G., Walter, J. Editions Inborn Metabolic Diseases: Diagnosis and Treatment. 5th

edition. New York, NY: Springer; 2012: Chapter 40.

Artículos más leídos del mismo autor/a